Salah satu daripada makanan di Hakodate ialah "mangkuk nasi makanan laut," yang terdiri daripada mangkuk nasi kukus panas atas dengan makanan laut baru ditangkap di atasnya. Kedai makanan yang khususnya menyediakan makanan kegemaran tempatan ini terletak dengan banyaknya di pasar pagi ("Asaichi"), di depan Stesen Hakodate.

Untuk makanan malam Jepun, cuba pub gaya Jepun atau "izakaya," di mana sake dan makanan sentiasa dipesan. Selain daripada hidangan makanan lazat yang disaji dengan hasil bermusim tempatan, izakaya Hakodate juga menawarkan pelawat peluang untuk menikmati perbualan dengan orang tempatan dan pemilik restoran.

34 restoran di Hakodate disenaraikan dalam “PANDUAN MICHELIN Hokkaido 2017.” Restoran Jepun, "Fumoto" menggunakan bahan tempatan yang segar dan menawarkan masakan Jepun yang lazat. Pelayan berpakaian kimono mesra menghidangkan pelanggan dalam bilik persendirian gaya Jepun. Panduan juga menyenaraikan restoran yang mengkhusus dalam sushi, makanan Jepun, Itali dan Sepanyol. Pastikan untuk mengalami restoran yang mendapat sambutan antarabangsa Hakodate!